Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORDQ00796 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORDQ00796 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORDQ00796 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORDQ00796 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORDQ00796 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORDQ00796 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORDQ00796 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORDQ00796 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORDQ00796 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORDQ00796 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORDQ00796 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SORDQ00796 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SORDQ00796 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORDQ00796 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORDQ00796 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORDQ00796 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms