Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDPQ00604 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDPQ00604 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDPQ00604 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms