Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms