Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms