Protein–RNA interactions for Protein: P58005

SESN3, Sestrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESN3P58005 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SESN3P58005 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SESN3P58005 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SESN3P58005 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SESN3P58005 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SESN3P58005 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SESN3P58005 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SESN3P58005 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SESN3P58005 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SESN3P58005 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SESN3P58005 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SESN3P58005 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SESN3P58005 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SESN3P58005 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SESN3P58005 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SESN3P58005 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SESN3P58005 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SESN3P58005 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms