Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP107P57740 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP107P57740 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms