Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP12AP54707 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms