Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms