Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SUCLG1P53597 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms