Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA4P51532 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA4P51532 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms