Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCLMP48507 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms