Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRATP43155 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRATP43155 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRATP43155 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms