Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCAMP43121 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCAMP43121 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCAMP43121 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCAMP43121 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCAMP43121 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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