Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PIK3CBP42338 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PIK3CBP42338 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms