Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP214P35658 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP214P35658 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms