Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms