Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCD1P33897 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCD1P33897 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms