Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms