Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCAP28676 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCAP28676 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCAP28676 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms