Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms