Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms