Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms