Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB9P28065 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms