Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LAMA1P25391 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LAMA1P25391 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms