Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms