Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPREP23469 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPREP23469 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPREP23469 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPREP23469 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPREP23469 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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