Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms