Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCP2P22307 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCP2P22307 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCP2P22307 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCP2P22307 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCP2P22307 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCP2P22307 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCP2P22307 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCP2P22307 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCP2P22307 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2P22307 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2P22307 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2P22307 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2P22307 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2P22307 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2P22307 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2P22307 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2P22307 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2P22307 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2P22307 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCP2P22307 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCP2P22307 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCP2P22307 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms