Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCMT1P22061 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms