Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD247P20963 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD247P20963 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD247P20963 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms