Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms