Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP4AP20648 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP4AP20648 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms