Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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