Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms