Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms