Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms