Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms