Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CT47B1P0C2W7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CT47B1P0C2W7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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