Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMG1P04279 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMG1P04279 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms