Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOC1P02654 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOC1P02654 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOC1P02654 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOC1P02654 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOC1P02654 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOC1P02654 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOC1P02654 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOC1P02654 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOC1P02654 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOC1P02654 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOC1P02654 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOC1P02654 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOC1P02654 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOC1P02654 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOC1P02654 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms