Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTAP01040 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTAP01040 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTAP01040 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTAP01040 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTAP01040 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTAP01040 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTAP01040 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTAP01040 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTAP01040 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTAP01040 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTAP01040 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTAP01040 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTAP01040 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTAP01040 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTAP01040 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTAP01040 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTAP01040 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTAP01040 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTAP01040 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTAP01040 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTAP01040 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTAP01040 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTAP01040 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTAP01040 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTAP01040 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTAP01040 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTAP01040 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTAP01040 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms