Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CBX7O95931 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms