Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN2BO60939 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms