Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms