Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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HOXA3O43365 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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HOXA3O43365 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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HOXA3O43365 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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HOXA3O43365 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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