Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBAG9O00559 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms