Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPA3F8WFD2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms