Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms