Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms