Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms